In Vitro Resistance of Commonly Prescribed Antimicrobial Agents Applied to Treat UTI in Shendi Locality

Abstract

Acknowledgement Firstly, praise and thanks be to God, thank you very much, good and blessed in it … praise until the praise reaches its limit. I am forever indebted to my supervisor Dr. Hadia Abass Eltaib Ahmed, for her countless hours of reflecting, reading, encouraging, patience, and excellent guidance throughout the entire research. She was the best example, the best honorable, and the best guide to knowledge and science. Also, grateful thanks must go to those who help me the practical part of my study Dr. Waseem Sameer Kwami, Us. Khalid Saeed, and also Us. Waleed Omer and all staff members of the Microbiology lab. I would also like to thank my colleague Us. Ghanem Mahjaf, for his wonderful advice and guidance throughout this period. Last, but not least I would like to thank all my friends, and my colleagues for their unlimited support and strong advice throughout this study.IV Abstract Introduction: One of the most serious issues in medicine was increasing resistance of Bactria to antimicrobial agents especially broad Spectrum antibiotics such as Cephalosporins. This fact is associated with higher mortality and morbidity rates, prolonged hospital stays and increased treatment related costs. Cephalosporins were the most prescribed treatment of infection causes by bacteria resistances to broad Spectrum of antibiotics. Objective: This study aimed to detect distribution of more frequented prescribed antibiotics resistance in all pathogens Isolated from clinical Samples of UTI patient in Shendi locality. Method: Cross-sectional and laboratory based study was carried out on 100 from UTI specimens, for 88(88%) of female,12(12%) of male in age group (20-40) 38(38%) found Shendi City 53(53%) and in Rural 47(47%). 111 types of pathogenic bacteria were isolated and identified using Gram stain, biochemical reactions and tested for their susceptibility to Cefixime, Ceftriaxone, Ciprofloxacin, Gentamicin and Norofloxcin a antibiotics was performed for all isolated bacteria from mid-stream urine samples. Results: The present of 24(24%)of urine sample was mixed and 76(76%) from unmixed, gram positive 36(32.5%) and gram negative 75(67.5%), most isolated bacteria comprising of 19(17.1%) p.vulgaris, 15(13.%) E.coli, 13(11.7%)S.aureus ,12(10.8%) S.epidermis ,11(9.9%)P.aregenosa ,7 (6.3%) Klebseilla pneumoniae,7(6.3%) Enterobacter species, 7(6.3%) S.saprofiticus,5(4.5%) M.morganii, 4(3.6%) P.mirabils, 4(3.6%) C.freundii, 4 (3.6%) S.fecalis and 3(2.7%) S.marcasin. The antimicrobial susceptibility testing showed was sensitive to Cefixime 4(3.6%), Ceftrixone 42(37.8),Ciprofloxcin75(67.5%), Norofloxcin 74 (66.7%), Gentamycin, found resistance to Cefixime 107 (96.4%), CeftriaxoneV 96.4(62.2%), Ciprofloxacin 36(32.4%), Norofloxcin 37(33.3%), Gentamicin 8(7.2%) . Conclusion: in this study the most isolate bacteria was P.vularis and the lower isolate bacteria was S.marcasin. in antimicrobial susceptibility testing show the most antibiotic sensitive was Gentamycin, Ciprofloxcin, Norofloxcin, Ceftrixone and Cefixime. The most antibiotic resistance was Cefixime, Ceftrixone, Norofloxcin and Ciprofloxcin and Gentamycin to all isolate bacteria from urine sample.VI   المقدمــــة: تعتبــر مقاومــة الباكتیریـــا والمــضادات الحیویــة مــن اخطـــر المــشاكل الطبیــة خاصـــة المــضادات الحیویــة واســعة الطیــف كالسیفاروریــسبورینات التــي تــرتبط بارتفــاع معــدلات المراضــة والوفیات والإقامة الطویلة بالمستشفى مع زیادة تكالیف العلاج. الأهـداف: هـدفت الدراسـة لمعرفـة البكتریـا المـسببة لالتهـاب مجـري المـسالك البولیـة ومعرفـه مـدي انتـشار مقاومـة المـضادات الحیویـة الموصـوفة بـشكل اكبـر لجمیـع مـسببات الامراضـي التهابـات مجري المسالك البولیة في منطقة شندي ومـا جاورهـا موزعـة بحـوالي ٥٣عینـة مـن المدینـة بنـسبة %٥٣وما حول المدینة بحولي ٤٧بنسبة .%٤٧ الطریقة: تم إجراء دراسة مقطعیة ومعملیة علـي ١٠٠عینـة مـن مرضـي التهابـات مجـري المـسالك البولیــة لعــدد ٨٨مــن النــساء بنــسبة %٨٨و ١٢عینــة مــن الرجــال بنــسبة %١٢فــي الفئــة العمریـة الموزعـة كـالآتي علـي كـلا الجنـسین :) (٤٠-٢٠بنـسبة ،%٣٨الفئـة العمریـة مـن -٤١ ٦٠بنـسبة %٣٢والفئــة العمریـة مــن ٨٠-٦١بنــسبة ،.%٣٠تـم عــزل ١١١نـوع مــن الباكتیریــا المـسبب لالتهابـات مجـري المـسالك البولیـة وتحدیـدها باسـتخدام صـبغة الجـرام ٕواجـراء التفـاعلات الكیمائیـــــة الحیویـــــة واختبـــــار الحـــــساسیة للمـــــضادات الحیویـــــة لمركبـــــات ســـــیف كـــــسیم، والسفترایكــسون، وســیبرو فلــو كــساسین، النوروفلوكــساسین، والجنتمایــسین باســتخدام وســط مــولر هینتون. النتــــائج: أظهــرت الدراســة أن العینــات المختلطــة عــددهم ٢٤بنــسبه %٢٤وان العینــات غیــر المختلطـة عـددهم ٧٦بنـسبه %٧٦وان عـدد الجـرام بوسـیتف ٣٦بنـسبه %٣٢. ٥وان عـدد الجـرام نقتــف ٧٥بنــسبه % ٦٧.٥المتقلبــة الــشائعة عــددها ١٩بنــسبه %١٧.١والاسكریــشیا القولونیــة عـــددها ١٥بنـــسبة %١٣.٥والعنقودیـــة الذهبیـــة عـــددها ١٣بنـــسبه %١١,٧والعنقودیـــة البـــشریة عـددها ١٢بنـسبة %١٠.٨والزائفـة الزنجباریـة عـددها١١بنـسبه %٩.٩والكلیبـشیلا لرئویـة عـددها ٧ بنــسبة % 6.3والبكتریــا المعویــة عــددها ٧بنــسبه %٦.٣والعنقودیــة المترممــة عــددها ٧بنــسبه %٦.٣و البكتریــا المورغانیــة عــددها ٥بنــسبة %٤.٥والمتقلبــة الرائعــة عــددها ٤بنــسبه %٣.٦ والبكتریــا الــستریة عــددها ٤بنــسبه % ٣.٦والمكــورات المعویــة عــددها ٤بنــسبه %٣.٦والــسراتیة الزابلـة عـددها ٣بنـسبه .%٢.٧أظهـر اختبـار الحـساسیة لمـضادات المیكروبـات أن الحـساسیة لـي السفكــسیم عــدده ٤بنــسبه %٣.٦والسفترایكــسون عــدده ٤٢بنــسبه %٣٧.٨والسبروفلوكــساسین عدده ٧٥بنسبه %٦٧.٧والنوروفلوكساین عدده ٧٤بنسبة ٦٦.٧و الجتامایسین عدده ١٠٣بنـسبه %٩٢.٨واظهــــــر اختبــــــار الحــــــساسیة انــــــه مقــــــاوم لــــــي السفكــــــسیم عــــــدده ١٠٧بنــــــسبه %٩٦.٤والسفترایكــــــسون عــــــدده ٦٩بنــــــسبه %٦٢.٢والسیبروفلوكــــــساسین ٣٦بنــــــسبه %٣٢VII والنوروفلوكساسین عدده ٣٧بنسبه %٣٣.٣و الجتاماسین عدده ٨بنسبه .%٧.٢ الخلاصـة: خلـصت الدراسـة أن أكثـر البكتریـا المـسببة لالتهـاب البـول هـي المتقلبـة الـشائعة ووجـدت أكثــر نــسبة للإصــابة فــي النــساء كمــا أظهــرت نتیجــة اختبــار الحــساسیة للمــضادات الحیویــة أن الجنتامایـسین اكثـر حـساسیة للبكتریـا المعزولـة یلیـه السبروفلوكـساین ثـم النوروفلوكـساسین ثـم إلـى سفترایكـسون ثـم واخیـرا السفكـسیم بینمـا شـكل الـسفكزیم اكبـر نـسبة مقاومـة لجمیـع البكتریـا المعزولـة یلیه السفترایكسون ثم النوروفلوكساسین ثم السبروفلوكساین وأخیرا الجنتامایسین