Detection of Helicobacterpylori Antigen and Cytotoxic Associated Gene in Stool Samples from Suspected Patients with Upper Gastroduodeneal Diseases in Shendi City

Abstract

ABSTRACT Helicobacter pylori was worldwide distributed with high prevalence rate and it is common bacterial infections in human gastro-duodenal tract. It possess several specific virulence factors greatly increases the risk of disease, the best recognized of these is the cytotoxic associated gene A (cagA) which induced more inflammation, ulceration and oncogenesis. This study a cross-section study carried out to determine the frequency of H. pylori in-patient suspected with upper gastro-duodenal disease using Stool Antigen Test and nested PCR, and determination of cytotoxic associated gene(CagA gene) by polymerase chain reaction ( PCR ) as most virulent factor. Moreover, to determine the sensitivity and specificity of stool antigen test (SAT) as diagnostic methods. Stool samples were collected from Shendi city from January2018 to 2020 from 100 patients(60% Males and 40% females) with mean age (37.2±11.8), statically analyzed by (SPSS version 22) (standard deviation, P value, Mean) There are significant association according to age group (P=0.027) and no significant association with gender (P = 0.919).The study reveals the frequency of H. pylori infection was 89%for SAT and 65% for PCR indicating low specificity for SAT (63.6%) with reasonable sensitivity (93.8%).Regarding detection the present of H.pylori and correlation of ICT and semi nested PCR with Symptoms, there was no statistical correlation with ICT (P.value 0.472) and with Significant Statistical Correlation with PCR (P.value 0.005). The study shows expression of CagA gene is 58% (35/65) indicating high virulent rate of H. pylori infection in study group. The study concludes that high frequency and virulent rates of H. pylori infection.XIII In this study there are no statistical correlation between present of CagA gene and age, gender, symptoms with (P.value 0.532, 0.834, 0.472). So properly managed to prevent chronic complication. Moreover, PCR recommended for diagnosis.XIV Y « hK الملوية البوابية متوزعة في جميع أنحاء العالم بمعدل انتشار مرتفـع والالتهابـات البكتيريـة الشائعة في الجهاز الهضمي البشري. الملوية البوابية تمتلك العديـد مـن عوامـل الـضراوة المحددة بشكل كبير التي تزيد من خطر الإصابة بالمرض، وأفضل ما يمكن التعرف عليه هو الجين المرتبط بالتسمم الخلوي الذي يسبب المزيد من الالتهاب والتقرح وتوليد الأورام. أجريت هذه الدراسة الوصفية القطعية لتحديد تواتر الملوية البوابية للمرضـي المـشتبه فـي إصابتهم بأمراض الجهاز الهضمي العلوي باستخدام اختبار مستضد البراز واختبـار تفاعـل البلمرة المتسلسل وتحديد الجين المرتبط بالتسمم الخلوي بواسطة تفاعـل البلمـرة المتسلـسل باعتباره العامل الأكثر ضراوة ,علاوة علي ذلك لتحديد حساسية وخصوصية مستضد البـراز كطريقه تشخيصيه تم جمع عينات البراز مـن ١٠٠مـريض ) %٦٠ذكـور و %٤٠إنـاث( بمتوسط عمر,تم تحليلها بشكل ثابت بواسطة برنامج الحزمة الإحصائية للعلـوم الاجتماعيـة ( )٣٧,٢±١١,٨الذي يعرف ببرنامج لتحليل بيانات الدراسة )الإصدار ) ( ٢٢قيمه احتماليـه، الانحراف المعياري، المتوسط ( هناك ارتباط حسب الفئة العمريـة بمعـدل قيمـة احتماليـة ) ( ٠،٠٢٧ولا يوجد ارتبط بالجنس بمعدل قيمة احتمالية )(٠،٩١٩وكشفت الدراسة أن تكرار الإصابة بالبكتيريا كانت %٨٩لاختبار مستضد البراز و % ٦٥لاختبـار تفاعـل البلمـرة المتسلسل مما يشير إلى انخفاض النوعية لاختبار مستضد البراز )(%٦٣,٦بحساسية معقولـة ) .(%٩٣,٨فيما يتعلق بوجود الملتوية البوابية وعلاقة اختبار البراز وتفاعل البلمرة المتسلسل مع الأعراض لا توجد علاقة ذات دلاله إحصائية مع اختبار مستضد البـراز بمعـدل قيمـه احتماليه ) (٠ .٤٧٢مع وجود علاقة ذات دلاله إحصائية مع تفاعل البلمرة المتسلسل بمعـدل قيمه احتماليه ).( ٠,٠٠٥ أظهرت الدراسة التعبير عن الجين المرتبط بالتسمم الخلوي هو (٣٥/٦٥) % ٥٨ممـا يـشير إلي ارتفاع معدل الإصابة بالملتوية البوابية في الدراسة. وخلصت الدراسة إلى أن الإصابة بالملتوية البوابية عالية التردد. في هذه الدراسة لا يوجد ارتباط إحصائي بين وجود الجين والجنس والعمـر والأعـراض بمعدل قيمه احتماليه0.472) ،0.834 ،(P.value 0.532. علاوة علي ذلك يوصي باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل للتشخيص